期货交易是一种金融衍生品交易方式，通过买入或卖出合约来获得利润。在期货交易中，佣金是交易者需要支付给期货经纪人的费用，它是根据交易的价值来计算的。

假设你有5000元的资金进行期货交易，那么你可以根据自己的判断选择合适的品种进行交易。不同的期货品种有不同的交易规则和佣金费率，所以在选择品种时需要进行充分的了解和研究。

以沪深300指数期货为例，假设你决定使用5000元进行交易，那么你可以通过期货经纪人开设的交易账户进行操作。期货经纪人会收取固定比例的佣金费用，通常在交易金额的千分之几到百分之几之间。

假设你选择的期货经纪人佣金费率为千分之三，那么你每次买入或卖出合约时需要支付的佣金费用为5000元乘以千分之三，即15元。这意味着你每次交易的成本将增加15元。

如果你进行多次交易，每次交易的佣金费用都是相同的，所以你需要将这部分费用计算在内。如果你能够做出正确的交易决策并获得盈利，那么你的佣金费用将会成为你赚取利润的一部分。

在期货交易中，赚取利润并不仅仅取决于佣金费用，还需要对市场走势有准确的判断和及时的操作。在进行期货交易时，一定要谨慎选择品种，合理控制风险，并且进行充分的市场分析和研究。

5000元进行期货交易时，佣金费用将成为你交易成本的一部分。根据不同的期货品种和经纪人的佣金费率，你需要根据自己的情况进行合理的选择。还需要具备良好的交易技巧和市场分析能力，才能在期货交易中获得盈利。